Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ino80dQ66JY2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80dQ66JY2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80dQ66JY2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80dQ66JY2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80dQ66JY2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80dQ66JY2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80dQ66JY2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80dQ66JY2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80dQ66JY2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80dQ66JY2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ino80dQ66JY2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms