Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrrc8eQ66JT1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrrc8eQ66JT1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms