Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ctnna3Q65CL1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms