Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Top2bQ64511 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Top2bQ64511 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms