Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim24Q64127 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim24Q64127 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms