Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Col4a5Q63ZW6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col4a5Q63ZW6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms