Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ift52Q62559 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms