Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vat1Q62465 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vat1Q62465 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms