Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CcncQ62447 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CcncQ62447 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms