Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Hoxa13Q62424 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Hoxa13Q62424 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Hoxa13Q62424 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Hoxa13Q62424 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
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Hoxa13Q62424 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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Hoxa13Q62424 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxa13Q62424 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxa13Q62424 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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