Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tff3Q62395 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tff3Q62395 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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