Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AtmQ62388 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AtmQ62388 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms