Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Zpr1Q62384 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zpr1Q62384 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zpr1Q62384 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zpr1Q62384 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zpr1Q62384 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zpr1Q62384 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms