Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim28Q62318 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim28Q62318 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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