Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Taf6Q62311 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms