Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sycp1Q62209 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms