Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sin3bQ62141 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sin3bQ62141 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms