Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prg2Q61878 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prg2Q61878 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms