Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd47Q61735 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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