Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtrxQ61687 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtrxQ61687 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms