Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rad21Q61550 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rad21Q61550 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms