Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vsx2Q61412 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vsx2Q61412 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms