Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tfap2bQ61313 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tfap2bQ61313 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms