Protein–RNA interactions for Protein: Q61194

Pik3c2a, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2aQ61194 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3c2aQ61194 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pik3c2aQ61194 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3c2aQ61194 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3c2aQ61194 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3c2aQ61194 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3c2aQ61194 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3c2aQ61194 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3c2aQ61194 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3c2aQ61194 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pik3c2aQ61194 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms