Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Grik1Q60934 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Grik1Q60934 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms