Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klf4Q60793 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms