Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cdkn2dQ60773 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdkn2dQ60773 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms