Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkn2cQ60772 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms