Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atf3Q60765 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atf3Q60765 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms