Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Mkrn3Q60764 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Mkrn3Q60764 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.4 ms