Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Epha1Q60750 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms