Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ItgaeQ60677 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgaeQ60677 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms