Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CttnQ60598 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CttnQ60598 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CttnQ60598 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CttnQ60598 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms