Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc1Q60596 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc1Q60596 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms