Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sin3aQ60520 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sin3aQ60520 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms