Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dnajc11Q5U458 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms