Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Brip1Q5SXJ3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Brip1Q5SXJ3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms