Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Med13Q5SWW4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms