Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ankrd40Q5SUE8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ankrd40Q5SUE8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms