Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TefmQ5SSK3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TefmQ5SSK3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms