Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf215Q5SPX3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms