Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc88aQ5SNZ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms