Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smg7Q5RJH6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smg7Q5RJH6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms