Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh12Q5RJH3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh12Q5RJH3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms