Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarf1Q5ND28 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarf1Q5ND28 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarf1Q5ND28 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Scarf1Q5ND28 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Scarf1Q5ND28 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms