Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5431Q5NCB3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5431Q5NCB3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms