Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
1810065E05RikQ5NC41 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1810065E05RikQ5NC41 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms