Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Nlrc3Q5DU56 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Nlrc3Q5DU56 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nlrc3Q5DU56 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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