Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc8bQ5DU41 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc8bQ5DU41 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms