Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp22Q5DU02 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp22Q5DU02 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms